Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20518E9Q548 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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