Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms