Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms