Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms