Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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