Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms