Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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