Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M5A7VMS3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M5A7VMS3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M5A7VMS3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-M5A7VMS3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-M5A7VMS3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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