Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6880A3KG45 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms