Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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