Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms