Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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