Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Krt27Q9Z320 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Krt27Q9Z320 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Krt27Q9Z320 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Krt27Q9Z320 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Krt27Q9Z320 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt27Q9Z320 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms