Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac5Q9Z2V6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms