Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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