Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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