Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn6Q9Z262 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn6Q9Z262 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn6Q9Z262 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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