Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms