Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms