Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Nek3Q9R0A5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek3Q9R0A5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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