Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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