Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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