Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms