Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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