Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hmgn5Q9JL35 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hmgn5Q9JL35 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hmgn5Q9JL35 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hmgn5Q9JL35 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hmgn5Q9JL35 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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