Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms