Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms