Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt112Q9DCG9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms