Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms