Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syde1Q9DBZ9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms