Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms