Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms