Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp27a1Q9DBG1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms