Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cab39lQ9DB16 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cab39lQ9DB16 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39lQ9DB16 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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