Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms