Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms