Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms