Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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