Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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