Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms