Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms