Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms