Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc167Q9D162 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms