Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms