Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ15

Gins1, DNA replication complex GINS protein PSF1, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins1Q9CZ15 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins1Q9CZ15 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms