Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CYI0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms