Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms