Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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