Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smurf1Q9CUN6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smurf1Q9CUN6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smurf1Q9CUN6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smurf1Q9CUN6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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