Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms